Donatello abre um portal para Gotham City em busca do recente aliado das Tartarugas, o Batman, mas ele acaba sendo enviado acidentalmente para a cidade. E outra pessoa atravessa o portal: Bane! O vilão que quebrou o Morcego encontra um outro mundo para conquistar e desenvolve uma nova cepa de Veneno para infligir à população de Nova York. Donnie leva Batman e Robin para o seu, mas quando eles, Mestre Splinter e o resto do quarteto não concordam com seu plano mirabolante para salvar a cidade, o desanimado Donatello resolve agir por conta própria…